Leczenie kanałowe pod mikroskopem - inaczej leczenie endodontyczne - zajmuje się chorobami miazgi zęba i tkanek okołowierzchołkowych. Leczenie kanałowe stanowi często ostatnią szansę na zachowanie naturalnego zęba. Pozwala na uniknięcie ekstrakcji (usunięcia), która zawsze powinna być rozwiązaniem ostatecznym.
Leczenie kanałowe polega na usunięciu miazgi zębowej i dokładnym oczyszczeniu oraz zdezynfekowaniu kanałów, a następnie szczelnym wypełnieniu ich plastycznym materiałem pochodzenia roślinnego- gutaperką.